清孔是要去掉除掉孔底沉淀的巖渣和泥漿水，以保障樁底和注入的鋼筋水泥品質，保障樁的承載力。所以沖孔樁機的清孔工作是不得馬虎的。大家清孔時需要注意以下事項：
1、沖孔樁機清孔后泥漿水比重扼制在1.05～1.15之間，粘度<22s，含砂率≤3％。
2、趁早補豐足夠的泥漿水或清水，始末維持樁孔中泥漿水面牢穩。
3、沖孔樁機清孔后查緝孔底沉渣合乎沖孔注入樁規范動工準許的范圍內時(<5cm)，迅即安插鋼筋籠。當鋼筋籠安插好、導管下好后，用導管施行第二次清孔。第二次清孔時間不少于30分鐘，標定孔底沉渣小于規范要求后，休止清孔。這時并沒有結束，接下來的操作細節也很重要。
最后清孔完畢后，盡量加快注入水泥，其間隔時間不可以大于30分鐘。沖孔樁機第二次清孔要復測孔深、沉碴厚度、泥漿水品質其要求和首次清孔要求如下所述：孔底500mm內的比重≤1.25、含砂率≤8％、粘度≤25s。經監理人答應后迅即澆灌砼。